Puutavaraa kuljetetaan myös aluksilla. Ne lastataan useimmiten aluksen mukana kuljetettavilla kuormaimilla ja koneilla. On myös mahdollista, että puutavara siirretään autokuormasta alukseen auton kuormaimella. Lastauksessa, samoin kuin lastauspaikalle varastoinnissa, on noudatettava paikallisia ja laivapäällystön ohjeita.
Esimerkkejä satama-asiointiohjeista: