Sienet aiheuttavat useimmat puuainemuutokset sekä kasvaville puille että hakatulle puutavaralle. Lisäksi hyönteiset, kuten kaarna- ja tikaskuoriaiset, levittävät sieniä iskeytyessään puutavaraan. Harmittomimpia sieniä puuaineen laadun kannalta ovat hakatussa puutavarassa esiintyvät homesienet. Ne muodostavat rihmastoja puun ulkopinnalle ja katkaisukohtiin.
VärivikaaYleisnimitys erilaisille puun värinmuutoksille. Värivika on useimmiten sienten aiheuttamaa, mutta myös entsyymireaktiot ja bakteerit voivat aiheuttaa puun värjäytymistä. More aiheuttavat sienet ovat hakatun puutavaran ongelma. Ne eivät yleensä tuhoa soluseinämiä, eivätkä näin ollen heikennä puuaineen rakennetta. VärivikaYleisnimitys erilaisille puun värinmuutoksille. Värivika on useimmiten sienten aiheuttamaa, mutta myös entsyymireaktiot ja bakteerit voivat aiheuttaa puun värjäytymistä. More alentaa laatua lähinnä saha- ja vaneritukeissa sekä kuusihiomopuussa. LahottajasienetYleisnimitys elävää tai kuollutta puuta hajottaville sienille. More hajottavat puuainetta, kuituja tai muita puun rakenneosia siten, ettei puu aina kelpaa aiottuun käyttökohteeseen. Lahoaminen vaikeuttaa myös tuotantoprosessia sekä heikentää lopputuotteiden ominaisuuksia ja laatua. Lahottajasieniä on kahdenlaisia: valkolahottajiaLahottajasieni, joka pystyy hajottamaan valikoivasti ligniiniä. Valkolahottajat voivat aiheuttaa joko vaaleaa valkolahoa tai ruskehtavaa korroosiolahoa. Valkolaho on yleistä koivulla, korroosiolaho kuusella. More, joiden lahotustyö alkaa ligniinistä sekä ruskolahottajiaLahottajasieni, joka hajottaa puun selluloosan ja hemiselluloosan, mutta jättää jäljelle ligniinin (ruskolaho). More, jotka aloittavat lahotustyön selluloosasta ja hemiselluloosasta.