Korjuuohjelmat suunnitellaan tehtaiden vastaanottosuunnitelmien mukaan. Tällöin on tiedettävä toimitettavien puumäärien kaukokuljetuksen aikataulutavoitteet. Erityisen tärkeää tämä on, kun kuljetusmuotona on rautatiekuljetus, jossa junan lastausaikataulut määräävät alkukuljetuksen ajankohdan. Yleensä kuljetusten suunnittelusta vastaa puunhankintaorganisaatio yhdessä kuljetusyrityksen kanssa. Alustava kuljetusohjelma kuljetusyrityksille tehdään yleensä suunnittelujaksoittain, jolloin kaikkien erien korjuuta ei ole välttämättä vielä aloitettu. Kuljetustilaukset tehdään usein lyhyelle ajanjaksolle ja ne perustuvat usein jo tienvarressa oleviin puihin. Kuljetusten eräkohtainen suunnittelu tehdään usein korjuun etenemisen mukaan.
Lähes aina kuljetuksen suunnittelusta vastaa jokin muu osapuoli kuin korjuuyritys. Yhteistyö ja yhteydenpito korjuun ja kuljetuksen suunnittelun välillä onkin tärkeää. Valmiita korjuu- ja kuljetusohjelmia voidaan joutua muuttamaan olosuhteiden mukaan tai kun puutavaran toimitustavoitteisiin tulee olennaisia muutoksia.
Kuljetuseriä koskevissa tiedoissa ovat mm.:
- erän tunnistetiedot (kauppa, metsänomistaja ym.)
- varastopaikkatiedot
- puutavaralaji, sen pituus ja määrä
- mittaustapa
- toimituspaikka ja -aika
Ajoneuvolle lähetettävässä kuljetusohjeessa on lisäksi kuljetusta, lastausta ja purkua koskevia muita tietoja.