Runkohinnoittelussa sovitaan puulajikohtaisesti minimimitat täyttävien runkojen tilavuusperusteisesta hinnasta. Tukki- ja kuitupuulle maksettavaa hintaa ei siten eritellä, vaan se on molemmilla sama, ja katkonta voidaan tehdä vapaasti hinnoittelutekijöistä riippumatta. Järeysrunkohinnoittelussa sovitaan keskijäreyteen perustuvat hintaportaat ja lopullinen yksikköhinta määräytyy korjatun kertymän keskijäreyden perusteella. Runkohinnoittelu on mieluinen hinnoittelumenetelmä, koska se antaa enemmän vapautta katkonnan suhteen. Korjuuta tehdessä voidaan katkonta tehdä vallitsevan markkina- ja varastotilanteen mukaan parhaalla mahdollisella tavalla. Haasteena hinnoittelussa on puuston laadun arvioiminen.